Šis M3 turi daugiausia iš vieno litro arklio galių išspaudžiantį atmosferinį variklį, kurį kada nors iki tol yra pagaminę BMW (neskaitant superautomobilio McLaren F1, kuris naudoja BMW variklį). 3.2 L 6 cilindrų linijoje variklis turi 343 AG (256 kW)/ 7900 rpm galią, sukimo momentas yra 365 Nm/4900 rpm, įsibėgėjimas 0-100 km/h tik per 4.6 s, 1/4 mylios - per 13.3 s, o didžiausias greitis - 298 km/h.

Apsukų raudona linija prasideda už 8000 apsukų žymės – pirmą kartą BMW automobilyje!

Buvo pagaminta ribota serija įspūdingos E46 GTR versijos automobilių, kurie turėjo 3,997 cc V8 variklį su 500 AG (368 kW). Buvo pagaminta tik 10 vienetų tokių automobilių, kiekvienas kurių kainavo 250.000 Eur. Automobilį gaminti buvo reikalinga tam, kad dalyvauti American Le Mans Series (ALMS) lenktynių serijoje. Vėliau du Schnitzer Motorsport GTR BMW automobiliai dalyvavo 24 valandų Nürburgring varžybose 2004 ir 2005 metais, kur pelnė 1 ir 2 vietas.